INDES fue creado el 8 de mayo de 1974, y obtuvo la personería jurídica que la autoriza a funcionar como Asociación Civil el 3 de marzo de 1975 bajo el N° 0524.
La Institución es dirigida y administrada por una Comisión Directiva formada por siete miembros elegidos por los socios en Asamblea Anual Ordinaria. Dichos miembros permanecen en sus cargos por dos años, pudiendo ser reelegidos en una nueva Asamblea.
INDES posee infraestructura propia compuesta por oficinas, vehículos y equipamiento informático en su sede central en la Ciudad Autónoma de Buenos Aires y en sus oficinas provinciales de las ciudades de Resistencia (provincia de Chaco), Goya (provincia de Corrientes) y Posadas (provincia de Misiones). Cada Programa Provincial tiene un Coordinador y un equipo técnico conformado por ingenieros agrónomos, antropólogos, trabajadores sociales, contadores y administrativos.
La labor institucional es llevada a cabo por estos equipos provinciales y la oficina central. Son actualmente 25 técnicos y 5 administrativos los que constituyen la estructura base, a la que se suman colaboradores y voluntarios, en algunos casos asociados de la Institución.
La actual Comisión Directiva está formada por:
- Presidente: Luis Bartra
- Vicepresidente: Ramón Ayala
- Secretaria: Analía Delssin
- Tesorero: Luis Alonzo
- Vocal 1: Carlos Turk
- Vocal 2: Fabián Foschiatti
Comisión Revisora de Cuentas:
- Revisor de Cuentas 1: Rubén Medina
- Revisor de Cuentas 2: Cristian Gómez
